Підземелля костелу знаходяться на глибині 8 м. нижче рівня землі. Збудовані на початку XVII століття за сприяння отців-єзуїтів. Підземні споруди використовувались для культового, оборонного, господарчого призначень. Також тут присутні поховання як місцевих жителів, так і видатних релігійних діячів. Зокрема, є 8 гробниць, призначених вочевидь для поховання духовенства.
На сьогоднішній день виявленими та дослідженими є 2 яруси підземелля. Втім, деякі архівні дані говорять про наявність 3 або й 4 ярусів. Проводяться роботи над їх виявленням та подальшим відкриттям.
У час радянський підземелля використовувались як склад для овочів та риби, тому багато змін підземні конструкції зазнали саме в цей період часу.
Нині ж турист має нагоду відвідати та побачити 12 залів, зокрема Нижній костел, сакристію, дальні галереї та кімнати, гробницю та трапезну залу, пройтись первісними сходами та потрапити до підземного колодязя.